Создание PNG с matplotlib, когда DISPLAY undefined

Я пытаюсь использовать networkx с Python. Когда я запускаю эту программу, она получает эту ошибку. Что-то не хватает?

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Теперь я получаю другую ошибку:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Теперь я получаю другую ошибку:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable
+290
10 мая '10 в 10:22
источник поделиться
12 ответов

Основная проблема заключается в том, что (в вашей системе) matplotlib по умолчанию использует x-using бэкэнд. У меня была одна и та же проблема на одном из моих серверов. Решение для меня заключалось в том, чтобы добавить следующий код в место, которое считывается перед любым другим pylab/matplotlib/ pyplot import:

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

Альтернативой является установка в вашем .matplotlibrc

+491
16 июн. '10 в 14:41
источник

Как дополнение к ответу Reinout.

Постоянный способ решить эту проблему - отредактировать файл .matplotlibrc. Найдите его через

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname() # This is the file location in Ubuntu '/etc/matplotlibrc'

Затем измените бэкэнд в этом файле на backend : Agg. Вот и все.

+69
17 нояб. '12 в 23:07
источник

Чистый ответ - потратить немного времени на правильную подготовку среды выполнения.

Первым методом, который вы должны подготовить среду исполнения, является использование файла matplotlibrc как это рекомендовано Крисом Q., установка

backend : Agg

в этом файле. Вы можете даже контролировать - без изменений кода - как и где matplotlib ищет и находит файл matplotlibrc.

Второй способ подготовки среды выполнения - использовать переменную среды MPLBACKEND (и информировать своих пользователей о том, чтобы использовать она):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

Это удобно, потому что вам даже не нужно предоставлять другой файл на диске, чтобы сделать эту работу. Я использовал этот подход, например, при тестировании в непрерывной интеграции и на удаленных компьютерах, у которых нет дисплеев.

Жесткое кодирование вашего бета-сервера matplotlib в "Agg" в вашем коде Python похоже на то, чтобы бить квадратную привязку в круглое отверстие с помощью большого молотка, когда вместо этого вы могли просто сказать, что matplotlib должен быть квадратным отверстием.

+40
28 мар. '16 в 21:53
источник

Я получил ошибку при использовании matplotlib через Spark. matplotlib.use('Agg') не работает для меня. В конце концов, для меня работает следующий код. Подробнее здесь

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')
+32
16 июн. '17 в 20:12
источник

Я просто повторю то, что сказал @Иво Бостицки, которого можно упустить. Поместите эти строки в начало ОЧЕНЬ файла py.

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

Или можно получить ошибку

*/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/__init__.py:923: UserWarning:  This call to   matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,*

Это решит проблему с отображением

+31
12 янв. '14 в 4:09
источник

При входе на сервер для выполнения кода используйте вместо этого:

ssh -X username@servername

-X избавится от отображаемого имени без переменной $DISPLAY ошибка

:)

+14
15 февр. '12 в 23:25
источник

Я обнаружил, что этот фрагмент хорошо работает при переключении между средами X и no-X.

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt
+12
02 дек. '16 в 11:59
источник

В какой системе вы работаете? Похоже, у вас есть система с X11, но переменная среды DISPLAY была неправильно настроена. Попробуйте выполнить следующую команду, а затем перезапустите свою программу:

export DISPLAY=localhost:0
+5
10 мая '10 в 10:37
источник

import matplotlib matplotlib.use('Agg') import matplotlib.pyplot as plt

Это работает для меня.

+4
04 янв. '18 в 3:02
источник

Еще одна вещь, которую нужно проверить, - авторизован ли ваш текущий пользователь для подключения к дисплею X. В моем случае root не мог этого сделать, и matplotlib жаловался с той же ошибкой.

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

источник: http://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

+3
27 февр. '12 в 22:57
источник

Для Google Learning Engine:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

И затем для печати в файл:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

и создать PDF файл:

multi_page(report_name)
+1
25 июн. '17 в 20:02
источник

Чтобы ваш код переносился на Windows, Linux и OSX, а также на системы с дисплеями и без них, я бы предложил следующий фрагмент:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Кредит: qaru.site/questions/476291/...

0
26 янв. '19 в 7:07
источник

Посмотрите другие вопросы по меткам или Задайте вопрос