Функции группировки (напр., По совокупности) и семейства * apply

Всякий раз, когда я хочу сделать что-то "map" py в R, я обычно пытаюсь использовать функцию в семействе apply.

Однако я никогда не понимал различий между ними: как { sapply, lapply и т.д.} применяют эту функцию к входному/сгруппированному входу, как будет выглядеть вывод, или даже то, что вход может быть - поэтому я часто просто просматриваю их все, пока не получу то, что хочу.

Может кто-нибудь объяснить, как использовать тот, когда?

Мое текущее (возможно неправильное/неполное) понимание...

  • sapply(vec, f): input - это вектор. output - вектор/матрица, где элемент i равен f(vec[i]), давая вам матрицу, если f имеет многоэлементный вывод

  • lapply(vec, f): то же, что и sapply, но вывод - это список?

  • apply(matrix, 1/2, f): input - это матрица. output - это вектор, где элемент i равен f (строка/col я матрицы)
  • tapply(vector, grouping, f): output - это матрица/массив, где элемент в матрице/массиве является значением f при группировке g вектора, а g попадает в строку /col имена
  • by(dataframe, grouping, f): пусть g - группировка. примените f к каждому столбцу группы /dataframe. достаточно напечатать группировку и значение f в каждом столбце.
  • aggregate(matrix, grouping, f): похоже на by, но вместо того, чтобы печатать вывод, агрегат вставляет все в кадр данных.

Боковой вопрос: я до сих пор не узнал plyr или не изменил форму - plyr или reshape полностью заменить все это?

+936
17 авг. '10 в 18:31
источник поделиться
9 ответов

R имеет множество * применяемых функций, которые хорошо описаны в файлах справки (например, ?apply). Однако их достаточно, что для начала использования Rs может возникнуть трудность в определении того, какой из них подходит для их ситуации или даже помнит их все. У них может быть общее мнение, что "я должен использовать функцию приложения * здесь", но сначала может быть сложно сохранить их все прямо.

Несмотря на то, что (в других ответах) большая часть функциональности семейства * apply распространяется на чрезвычайно популярный пакет plyr, базовые функции остаются полезными и заслуживают внимания.

Этот ответ предназначен для использования в качестве своего рода знака для новых useRs, чтобы помочь направить их на правильную * применимую функцию для их конкретной проблемы. Обратите внимание, что это не, предназначенное для простого опрокидывания или замены документации R! Надежда состоит в том, что этот ответ поможет вам решить, какая функция * подходит для вашей ситуации, и тогда вам решать ее дальше. За одним исключением различия производительности не будут устранены.

  • применить. Если вы хотите применить функцию к строкам или столбцам матрицы (и многомерных аналогов); обычно не рекомендуется для фреймов данных, поскольку он сначала будет принуждать к матрице.

    # Two dimensional matrix
    M <- matrix(seq(1,16), 4, 4)
    
    # apply min to rows
    apply(M, 1, min)
    [1] 1 2 3 4
    
    # apply max to columns
    apply(M, 2, max)
    [1]  4  8 12 16
    
    # 3 dimensional array
    M <- array( seq(32), dim = c(4,4,2))
    
    # Apply sum across each M[*, , ] - i.e Sum across 2nd and 3rd dimension
    apply(M, 1, sum)
    # Result is one-dimensional
    [1] 120 128 136 144
    
    # Apply sum across each M[*, *, ] - i.e Sum across 3rd dimension
    apply(M, c(1,2), sum)
    # Result is two-dimensional
         [,1] [,2] [,3] [,4]
    [1,]   18   26   34   42
    [2,]   20   28   36   44
    [3,]   22   30   38   46
    [4,]   24   32   40   48
    

    Если вы хотите использовать значения строк или столбцов для двумерной матрицы, убедитесь, что исследовать высокооптимизированный, молниеносный colMeans, rowMeans, colSums, rowSums.

  • lapply. Если вы хотите применить функцию к каждому элементу список в свою очередь и получить список назад.

    Это рабочая лошадка многих других * применимых функций. корка верните их код, и вы часто найдете под ним lapply.

    x <- list(a = 1, b = 1:3, c = 10:100) 
    lapply(x, FUN = length) 
    $a 
    [1] 1
    $b 
    [1] 3
    $c 
    [1] 91
    lapply(x, FUN = sum) 
    $a 
    [1] 1
    $b 
    [1] 6
    $c 
    [1] 5005
    
  • sapply. Если вы хотите применить функцию к каждому элементу в свою очередь, но вам нужен вектор, а не список.

    Если вы набрали unlist(lapply(...)), остановитесь и рассмотрите sapply.

    x <- list(a = 1, b = 1:3, c = 10:100)
    # Compare with above; a named vector, not a list 
    sapply(x, FUN = length)  
    a  b  c   
    1  3 91
    
    sapply(x, FUN = sum)   
    a    b    c    
    1    6 5005 
    

    В более сложных целях использования sapply он попытается принудить результат в многомерном массиве, если это необходимо. Например, если наша функция возвращает векторы одинаковой длины, sapply будет использовать их в качестве столбцов матрицы:

    sapply(1:5,function(x) rnorm(3,x))
    

    Если наша функция возвращает 2-мерную матрицу, sapply будет делать по существу одно и то же, рассматривая каждую возвращаемую матрицу как один длинный вектор:

    sapply(1:5,function(x) matrix(x,2,2))
    

    Если мы не укажем simplify = "array", в этом случае он будет использовать отдельные матрицы для построения многомерного массива:

    sapply(1:5,function(x) matrix(x,2,2), simplify = "array")
    

    Каждое из этих поведений, конечно, зависит от нашей функции, возвращающей векторы или матрицы одинаковой длины или размера.

  • vapply. Если вы хотите использовать sapply, но, возможно, вам понадобится сжимайте еще немного скорости из вашего кода.

    Для vapply вы в основном даете R пример того, что ваша функция вернется, что может сэкономить некоторое время, вызванное возвратом значения для одного атомного вектора.

    x <- list(a = 1, b = 1:3, c = 10:100)
    #Note that since the advantage here is mainly speed, this
    # example is only for illustration. We're telling R that
    # everything returned by length() should be an integer of 
    # length 1. 
    vapply(x, FUN = length, FUN.VALUE = 0L) 
    a  b  c  
    1  3 91
    
  • mapply. Если у вас несколько структур данных (например, векторы, списки), и вы хотите применить функцию к 1-му элементам каждого, а затем 2-го элемента каждого и т.д., приводя к результату к вектору/массиву, как в sapply.

    Это многомерность в том смысле, что ваша функция должна принимать несколько аргументов.

    #Sums the 1st elements, the 2nd elements, etc. 
    mapply(sum, 1:5, 1:5, 1:5) 
    [1]  3  6  9 12 15
    #To do rep(1,4), rep(2,3), etc.
    mapply(rep, 1:4, 4:1)   
    [[1]]
    [1] 1 1 1 1
    
    [[2]]
    [1] 2 2 2
    
    [[3]]
    [1] 3 3
    
    [[4]]
    [1] 4
    
  • Карта. Оболочка mapply с SIMPLIFY = FALSE, поэтому гарантированно вернет список.

    Map(sum, 1:5, 1:5, 1:5)
    [[1]]
    [1] 3
    
    [[2]]
    [1] 6
    
    [[3]]
    [1] 9
    
    [[4]]
    [1] 12
    
    [[5]]
    [1] 15
    
  • rapply. Если вы хотите применить функцию к каждому элементу структуры вложенного списка, рекурсивно.

    Чтобы дать вам некоторое представление о том, насколько необычен rapply, я забыл об этом при первом отправке этого ответа! Очевидно, я уверен, что многие используют его, но YMMV. rapply лучше всего иллюстрируется пользовательской функцией:

    # Append ! to string, otherwise increment
    myFun <- function(x){
        if(is.character(x)){
          return(paste(x,"!",sep=""))
        }
        else{
          return(x + 1)
        }
    }
    
    #A nested list structure
    l <- list(a = list(a1 = "Boo", b1 = 2, c1 = "Eeek"), 
              b = 3, c = "Yikes", 
              d = list(a2 = 1, b2 = list(a3 = "Hey", b3 = 5)))
    
    
    # Result is named vector, coerced to character          
    rapply(l, myFun)
    
    # Result is a nested list like l, with values altered
    rapply(l, myFun, how="replace")
    
  • tapply. Если вы хотите применить функцию к подмножествам вектор и подмножества определяются каким-либо другим вектором, обычно фактор.

    Черная овца * применяет семейство. Использование файла справки фраза "оборванный массив" может быть немного запутанной, но на самом деле довольно просто.

    Вектор:

    x <- 1:20
    

    Коэффициент (той же длины!), определяющий группы:

    y <- factor(rep(letters[1:5], each = 4))
    

    Добавьте значения в x в пределах каждой подгруппы, определенной y:

    tapply(x, y, sum)  
     a  b  c  d  e  
    10 26 42 58 74 
    

    Более сложные примеры можно обрабатывать там, где определены подгруппы уникальными комбинациями списка из нескольких факторов. tapply является аналогичные по духу функциям split-apply-comb, которые общий в R (aggregate, by, ave, ddply и т.д.). Следовательно, его черный овец.

+1219
21 авг. '11 в 22:50
источник

С другой стороны, вот как различные функции plyr соответствуют базовым функциям *apply (от ввода к документу plyr с веб-страницы plyr http://had.co.nz/plyr/)

Base function   Input   Output   plyr function 
---------------------------------------
aggregate        d       d       ddply + colwise 
apply            a       a/l     aaply / alply 
by               d       l       dlply 
lapply           l       l       llply  
mapply           a       a/l     maply / mlply 
replicate        r       a/l     raply / rlply 
sapply           l       a       laply 

Одной из целей plyr является предоставление согласованных соглашений об именах для каждой из функций, кодирующих типы входных и выходных данных в имени функции. Он также обеспечивает согласованность вывода, поскольку вывод из dlply() легко проходит к ldply() для получения полезного вывода и т.д.

Концептуально, обучение plyr не более сложно, чем понимание базовых функций *apply.

Функции

plyr и reshape заменили почти все эти функции в моем ежедневном использовании. Но, также из документа Intro to Plyr:

Связанные функции tapply и sweep не имеют соответствующей функции в plyr и остаются полезными. merge полезен для комбинирования сумм с исходными данными.

+174
17 авг. '10 в 19:20
источник
другие ответы

Связанные вопросы


Похожие вопросы

Из слайда 21 http://www.slideshare.net/hadley/plyr-one-data-analytic-strategy:

apply, sapply, lapply, by, aggregate

(Надеюсь, ясно, что apply соответствует @Hadley aaply и aggregate соответствует @Hadley ddply и т.д. Слайд 20 из того же слайд-шоу прояснит, не получите ли вы его от этого изображения. )

(слева находится вход, сверху отображается)

+121
09 окт. '11 в 5:29
источник

Сначала начните с Joran отличный ответ - сомнительно, что что-то может улучшить это.

Тогда следующие мнемоники могут помочь запомнить различия между ними. В то время как некоторые из них очевидны, другие могут быть менее такими - для них вы найдете оправдание в обсуждениях Джорана.

Мнемоник

  • lapply - это список, который действует в списке или векторе и возвращает список.
  • sapply - это простой lapply (функция по умолчанию возвращает вектор или матрицу, когда это возможно)
  • vapply - это проверенное применение (позволяет задавать тип возвращаемого объекта)
  • rapply - это рекурсивное применение для вложенных списков, т.е. списков в списках
  • tapply применяется с тегами, где теги идентифицируют подмножества
  • apply является общим: применяет функцию к матричным строкам или столбцам (или, более общо, к размерам массива)

Создание правильного фона

Если использование семейства apply все еще немного чуждо вам, возможно, вам не хватает ключевой точки зрения.

Эти две статьи могут помочь. Они обеспечивают необходимый фон для мотивации методов функционального программирования, предоставляемых семейством функций apply.

Пользователи Lisp сразу узнают парадигму. Если вы не знакомы с Lisp, как только вы пойдете вокруг FP, вы приобретете мощную точку зрения для использования в R - и apply, что будет иметь больший смысл.

+89
25 апр. '14 в 0:20
источник

Так как я понял, что (очень превосходные) ответы на этот пост недостаток by и aggregate объяснений. Вот мой вклад.

ПО

Функция by, как указано в документации, может быть, однако, как "обертка" для tapply. Сила by возникает, когда мы хотим вычислить задачу, которую tapply не может обрабатывать. Одним из примеров является этот код:

ct <- tapply(iris$Sepal.Width , iris$Species , summary )
cb <- by(iris$Sepal.Width , iris$Species , summary )

 cb
iris$Species: setosa
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.300   3.200   3.400   3.428   3.675   4.400 
-------------------------------------------------------------- 
iris$Species: versicolor
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.000   2.525   2.800   2.770   3.000   3.400 
-------------------------------------------------------------- 
iris$Species: virginica
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.200   2.800   3.000   2.974   3.175   3.800 


ct
$setosa
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.300   3.200   3.400   3.428   3.675   4.400 

$versicolor
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.000   2.525   2.800   2.770   3.000   3.400 

$virginica
   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
  2.200   2.800   3.000   2.974   3.175   3.800 

Если мы напечатаем эти два объекта ct и cb, мы "по существу" получим те же результаты, и единственные различия в том, как они показаны, и разные атрибуты class, соответственно by для cb и array для ct.

Как я уже сказал, сила by возникает, когда мы не можем использовать tapply; следующим примером является следующий пример:

 tapply(iris, iris$Species, summary )
Error in tapply(iris, iris$Species, summary) : 
  arguments must have same length

R говорит, что аргументы должны иметь одинаковую длину, например "мы хотим рассчитать summary всей переменной в iris по коэффициенту Species": но R просто не может этого сделать, потому что это не знать, как обращаться.

С помощью функции by R отправляет специальный метод для класса data frame, а затем пусть функция summary работает, даже если длина первого аргумента (и тип тоже) различна.

bywork <- by(iris, iris$Species, summary )

bywork
iris$Species: setosa
  Sepal.Length    Sepal.Width     Petal.Length    Petal.Width          Species  
 Min.   :4.300   Min.   :2.300   Min.   :1.000   Min.   :0.100   setosa    :50  
 1st Qu.:4.800   1st Qu.:3.200   1st Qu.:1.400   1st Qu.:0.200   versicolor: 0  
 Median :5.000   Median :3.400   Median :1.500   Median :0.200   virginica : 0  
 Mean   :5.006   Mean   :3.428   Mean   :1.462   Mean   :0.246                  
 3rd Qu.:5.200   3rd Qu.:3.675   3rd Qu.:1.575   3rd Qu.:0.300                  
 Max.   :5.800   Max.   :4.400   Max.   :1.900   Max.   :0.600                  
-------------------------------------------------------------- 
iris$Species: versicolor
  Sepal.Length    Sepal.Width     Petal.Length   Petal.Width          Species  
 Min.   :4.900   Min.   :2.000   Min.   :3.00   Min.   :1.000   setosa    : 0  
 1st Qu.:5.600   1st Qu.:2.525   1st Qu.:4.00   1st Qu.:1.200   versicolor:50  
 Median :5.900   Median :2.800   Median :4.35   Median :1.300   virginica : 0  
 Mean   :5.936   Mean   :2.770   Mean   :4.26   Mean   :1.326                  
 3rd Qu.:6.300   3rd Qu.:3.000   3rd Qu.:4.60   3rd Qu.:1.500                  
 Max.   :7.000   Max.   :3.400   Max.   :5.10   Max.   :1.800                  
-------------------------------------------------------------- 
iris$Species: virginica
  Sepal.Length    Sepal.Width     Petal.Length    Petal.Width          Species  
 Min.   :4.900   Min.   :2.200   Min.   :4.500   Min.   :1.400   setosa    : 0  
 1st Qu.:6.225   1st Qu.:2.800   1st Qu.:5.100   1st Qu.:1.800   versicolor: 0  
 Median :6.500   Median :3.000   Median :5.550   Median :2.000   virginica :50  
 Mean   :6.588   Mean   :2.974   Mean   :5.552   Mean   :2.026                  
 3rd Qu.:6.900   3rd Qu.:3.175   3rd Qu.:5.875   3rd Qu.:2.300                  
 Max.   :7.900   Max.   :3.800   Max.   :6.900   Max.   :2.500     

он работает действительно, и результат очень удивителен. Это объект класса by, который вдоль Species (скажем, для каждого из них) вычисляет summary каждой переменной.

Обратите внимание, что если первым аргументом является data frame, отправленная функция должна иметь метод для этого класса объектов. Например, мы используем этот код с функцией mean, у нас будет этот код, который вообще не имеет смысла:

 by(iris, iris$Species, mean)
iris$Species: setosa
[1] NA
------------------------------------------- 
iris$Species: versicolor
[1] NA
------------------------------------------- 
iris$Species: virginica
[1] NA
Warning messages:
1: In mean.default(data[x, , drop = FALSE], ...) :
  argument is not numeric or logical: returning NA
2: In mean.default(data[x, , drop = FALSE], ...) :
  argument is not numeric or logical: returning NA
3: In mean.default(data[x, , drop = FALSE], ...) :
  argument is not numeric or logical: returning NA

ОБЩИЙ

aggregate можно рассматривать как другой способ использования tapply, если мы будем использовать его таким образом.

at <- tapply(iris$Sepal.Length , iris$Species , mean)
ag <- aggregate(iris$Sepal.Length , list(iris$Species), mean)

 at
    setosa versicolor  virginica 
     5.006      5.936      6.588 
 ag
     Group.1     x
1     setosa 5.006
2 versicolor 5.936
3  virginica 6.588

Два непосредственных отличия заключаются в том, что второй аргумент aggregate должен быть списком, тогда как tapply может (не обязательно) быть списком и что вывод of aggregate - это кадр данных, а один из tapply - array.

Сила aggregate заключается в том, что она может обрабатывать легко подмножества данных с аргументом subset и что у нее есть методы для объектов ts и formula.

Эти элементы упрощают работу aggregate с этим tapply в некоторых ситуациях. Вот несколько примеров (доступно в документации):

ag <- aggregate(len ~ ., data = ToothGrowth, mean)

 ag
  supp dose   len
1   OJ  0.5 13.23
2   VC  0.5  7.98
3   OJ  1.0 22.70
4   VC  1.0 16.77
5   OJ  2.0 26.06
6   VC  2.0 26.14

Мы можем достичь того же значения с tapply, но синтаксис немного сложнее, а выход (в некоторых случаях) менее читабельный:

att <- tapply(ToothGrowth$len, list(ToothGrowth$dose, ToothGrowth$supp), mean)

 att
       OJ    VC
0.5 13.23  7.98
1   22.70 16.77
2   26.06 26.14

Есть другие случаи, когда мы не можем использовать by или tapply, и мы должны использовать aggregate.

 ag1 <- aggregate(cbind(Ozone, Temp) ~ Month, data = airquality, mean)

 ag1
  Month    Ozone     Temp
1     5 23.61538 66.73077
2     6 29.44444 78.22222
3     7 59.11538 83.88462
4     8 59.96154 83.96154
5     9 31.44828 76.89655

Мы не можем получить предыдущий результат с помощью tapply в одном вызове, но мы должны вычислить среднее значение по Month для каждого элемента и затем объединить их (также обратите внимание, что мы должны называть na.rm = TRUE, потому что formula методы функции aggregate по умолчанию имеют значение na.action = na.omit):

ta1 <- tapply(airquality$Ozone, airquality$Month, mean, na.rm = TRUE)
ta2 <- tapply(airquality$Temp, airquality$Month, mean, na.rm = TRUE)

 cbind(ta1, ta2)
       ta1      ta2
5 23.61538 65.54839
6 29.44444 79.10000
7 59.11538 83.90323
8 59.96154 83.96774
9 31.44828 76.90000

в то время как с by мы просто не можем добиться того, что на самом деле следующий вызов функции возвращает ошибку (но, скорее всего, она связана с предоставленной функцией, mean):

by(airquality[c("Ozone", "Temp")], airquality$Month, mean, na.rm = TRUE)

В других случаях результаты одинаковы, а различия находятся только в классе (а затем как он отображается/печатается, а не только - например, как его подмножать):

byagg <- by(airquality[c("Ozone", "Temp")], airquality$Month, summary)
aggagg <- aggregate(cbind(Ozone, Temp) ~ Month, data = airquality, summary)

Предыдущий код достигает той же цели и результатов, в некоторых случаях какой инструмент использовать - это только вопрос личных вкусов и потребностей; предыдущие два объекта имеют очень разные потребности в терминах подмножества.

+41
28 авг. '15 в 2:28
источник

Есть много замечательных ответов, в которых обсуждаются различия в вариантах использования для каждой функции. Ни один из ответов не говорит о различиях в производительности. Это разумная причина, по которой различные функции ожидают различного ввода и производят различную продукцию, но большинство из них имеют общую общую цель для оценки по группам/группам. Мой ответ будет сосредоточен на производительности. Из-за выше входное создание из векторов включено в синхронизацию, также функция apply не измеряется.

Я проверил сразу две разные функции sum и length. Тестируемый объем составляет 50 М на входе и 50 КВ на выходе. Я также включил два популярных в настоящее время пакета, которые не были широко использованы в момент запроса вопроса, data.table и dplyr. Оба, безусловно, стоит посмотреть, если вы нацелены на хорошую работу.

library(dplyr)
library(data.table)
set.seed(123)
n = 5e7
k = 5e5
x = runif(n)
grp = sample(k, n, TRUE)

timing = list()

# sapply
timing[["sapply"]] = system.time({
    lt = split(x, grp)
    r.sapply = sapply(lt, function(x) list(sum(x), length(x)), simplify = FALSE)
})

# lapply
timing[["lapply"]] = system.time({
    lt = split(x, grp)
    r.lapply = lapply(lt, function(x) list(sum(x), length(x)))
})

# tapply
timing[["tapply"]] = system.time(
    r.tapply <- tapply(x, list(grp), function(x) list(sum(x), length(x)))
)

# by
timing[["by"]] = system.time(
    r.by <- by(x, list(grp), function(x) list(sum(x), length(x)), simplify = FALSE)
)

# aggregate
timing[["aggregate"]] = system.time(
    r.aggregate <- aggregate(x, list(grp), function(x) list(sum(x), length(x)), simplify = FALSE)
)

# dplyr
timing[["dplyr"]] = system.time({
    df = data_frame(x, grp)
    r.dplyr = summarise(group_by(df, grp), sum(x), n())
})

# data.table
timing[["data.table"]] = system.time({
    dt = setnames(setDT(list(x, grp)), c("x","grp"))
    r.data.table = dt[, .(sum(x), .N), grp]
})

# all output size match to group count
sapply(list(sapply=r.sapply, lapply=r.lapply, tapply=r.tapply, by=r.by, aggregate=r.aggregate, dplyr=r.dplyr, data.table=r.data.table), 
       function(x) (if(is.data.frame(x)) nrow else length)(x)==k)
#    sapply     lapply     tapply         by  aggregate      dplyr data.table 
#      TRUE       TRUE       TRUE       TRUE       TRUE       TRUE       TRUE 

# print timings
as.data.table(sapply(timing, `[[`, "elapsed"), keep.rownames = TRUE
              )[,.(fun = V1, elapsed = V2)
                ][order(-elapsed)]
#          fun elapsed
#1:  aggregate 109.139
#2:         by  25.738
#3:      dplyr  18.978
#4:     tapply  17.006
#5:     lapply  11.524
#6:     sapply  11.326
#7: data.table   2.686
+30
08 дек. '15 в 22:42
источник

Возможно, стоит упомянуть ave. ave tapply дружелюбный кузен. Он возвращает результаты в форме, которую вы можете подключить прямо к вашему кадру данных.

dfr <- data.frame(a=1:20, f=rep(LETTERS[1:5], each=4))
means <- tapply(dfr$a, dfr$f, mean)
##  A    B    C    D    E 
## 2.5  6.5 10.5 14.5 18.5 

## great, but putting it back in the data frame is another line:

dfr$m <- means[dfr$f]

dfr$m2 <- ave(dfr$a, dfr$f, FUN=mean) # NB argument name FUN is needed!
dfr
##   a f    m   m2
##   1 A  2.5  2.5
##   2 A  2.5  2.5
##   3 A  2.5  2.5
##   4 A  2.5  2.5
##   5 B  6.5  6.5
##   6 B  6.5  6.5
##   7 B  6.5  6.5
##   ...

В базовом пакете ничего не работает, как ave для целых фреймов данных (как by как tapply для фреймов данных). Но вы можете выдумать это:

dfr$foo <- ave(1:nrow(dfr), dfr$f, FUN=function(x) {
    x <- dfr[x,]
    sum(x$m*x$m2)
})
dfr
##     a f    m   m2    foo
## 1   1 A  2.5  2.5    25
## 2   2 A  2.5  2.5    25
## 3   3 A  2.5  2.5    25
## ...
+21
06 нояб. '14 в 0:00
источник

Несмотря на все замечательные ответы здесь, есть еще две базовые функции, которые заслуживают упоминания, полезная функция outer и неявная eapply функция

внешняя

outer - очень полезная функция, скрытая как более обыденная. Если вы прочитали справку для outer, в ее описании говорится:

The outer product of the arrays X and Y is the array A with dimension  
c(dim(X), dim(Y)) where element A[c(arrayindex.x, arrayindex.y)] =   
FUN(X[arrayindex.x], Y[arrayindex.y], ...).

из-за чего кажется, что это полезно только для вещей типа линейной алгебры. Однако его можно использовать так же, как mapply, чтобы применить функцию к двум векторам входных данных. Разница в том, что mapply применит эту функцию к первым двум элементам, а затем ко второй и т.д., Тогда как outer применит эту функцию к каждой комбинации одного элемента из первого вектора, а вторая - к второй. Например:

 A<-c(1,3,5,7,9)
 B<-c(0,3,6,9,12)

mapply(FUN=pmax, A, B)

> mapply(FUN=pmax, A, B)
[1]  1  3  6  9 12

outer(A,B, pmax)

 > outer(A,B, pmax)
      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
 [1,]    1    3    6    9   12
 [2,]    3    3    6    9   12
 [3,]    5    5    6    9   12
 [4,]    7    7    7    9   12
 [5,]    9    9    9    9   12

Я лично использовал это, когда у меня есть вектор значений и вектор условий и хочу видеть, какие значения соответствуют тем условиям.

eapply

eapply похож на lapply, за исключением того, что вместо применения функции к каждому элементу в списке он применяет функцию к каждому элементу в среде. Например, если вы хотите найти список пользовательских функций в глобальной среде:

A<-c(1,3,5,7,9)
B<-c(0,3,6,9,12)
C<-list(x=1, y=2)
D<-function(x){x+1}

> eapply(.GlobalEnv, is.function)
$A
[1] FALSE

$B
[1] FALSE

$C
[1] FALSE

$D
[1] TRUE 

Откровенно говоря, я не использую это очень много, но если вы создаете много пакетов или создаете множество сред, это может пригодиться.

+21
16 мая '16 в 3:59
источник

Недавно я обнаружил довольно полезную функцию sweep и добавил ее здесь для полноты:

подметать

Основная идея состоит в том, чтобы прокручивать массив row- или по столбцам и возвращать модифицированный массив. Пример сделает это ясно (source: datacamp):

Скажем, у вас есть матрица и вы хотите стандартизировать ее по столбцам:

dataPoints <- matrix(4:15, nrow = 4)

# Find means per column with 'apply()'
dataPoints_means <- apply(dataPoints, 2, mean)

# Find standard deviation with 'apply()'
dataPoints_sdev <- apply(dataPoints, 2, sd)

# Center the points 
dataPoints_Trans1 <- sweep(dataPoints, 2, dataPoints_means,"-")
print(dataPoints_Trans1)
##      [,1] [,2] [,3]
## [1,] -1.5 -1.5 -1.5
## [2,] -0.5 -0.5 -0.5
## [3,]  0.5  0.5  0.5
## [4,]  1.5  1.5  1.5
# Return the result
dataPoints_Trans1
##      [,1] [,2] [,3]
## [1,] -1.5 -1.5 -1.5
## [2,] -0.5 -0.5 -0.5
## [3,]  0.5  0.5  0.5
## [4,]  1.5  1.5  1.5
# Normalize
dataPoints_Trans2 <- sweep(dataPoints_Trans1, 2, dataPoints_sdev, "/")

# Return the result
dataPoints_Trans2
##            [,1]       [,2]       [,3]
## [1,] -1.1618950 -1.1618950 -1.1618950
## [2,] -0.3872983 -0.3872983 -0.3872983
## [3,]  0.3872983  0.3872983  0.3872983
## [4,]  1.1618950  1.1618950  1.1618950

NB: для этого простого примера можно, конечно, добиться того же результата
apply(dataPoints, 2, scale)

+8
16 июн. '17 в 16:03
источник

Посмотрите другие вопросы по меткам или Задайте вопрос